※ 위에서 보는 바와 같이 보유기간에 따라 공제율이 다르므로 보유기간이 3년, 5년, 10년 가까이 된 토지와 건물을 양도하고자 하는 경우에는 보유기간이 3년, 5년 또는 10년 이상이 되도록 하여 양도하면 세금을 조금이라도 줄일 수 있다. 예를 들어 상가를 매입하여 임대하다가 5천만원을 남기고 양도한 경우 보유기간에 따른 세부담을 비교해 보면 다음과 같다. 1) 보유기간이 3년 내외인 경우 - 보유기간이 2년 10월인 경우 : 8,325,000원 - 보유기간이 3년 1월인 경우 : 6,975,000원(∇ 1,350,000원) 2) 보유기간이 5년 내외인 경우 - 보유기간이 4년 10월인 경우 : 6,975,000원 - 보유기간이 5년 1월인 경우 : 6,300,000원(∇ 675,000원) 3) 보유기간이 10년 내외인 경우 - 보유기간이 9년 10월인 경우 : 6,300,000원 - 보유기간이 10년 1월인 경우 : 4,950,000원 (∇ 1,350,000원)
다만, 미등기 양도 자산이나 60% 중과대상인 1세대 3주택 이상자가 2004. 1. 1 이후 양도하는 주택에 대하여는 장기간 보유하였더라도 “장기보유특별공제”를 적용받을 수 없다.
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